MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 52982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009051	GCG	2	6	257554	257559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178229
5502	NC_009051	CCT	2	6	257565	257570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178229
5503	NC_009051	TTC	2	6	257579	257584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178229
5504	NC_009051	GCCG	2	8	257614	257621	0 %	0 %	50 %	50 %	126178229
5505	NC_009051	ACG	2	6	257678	257683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178229
5506	NC_009051	CCG	2	6	257739	257744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178229
5507	NC_009051	CCGT	2	8	257834	257841	0 %	25 %	25 %	50 %	126178229
5508	NC_009051	GCC	2	6	257853	257858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178229
5509	NC_009051	CGA	2	6	257913	257918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178229
5510	NC_009051	GC	3	6	257919	257924	0 %	0 %	50 %	50 %	126178229
5511	NC_009051	ACG	2	6	257936	257941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178229
5512	NC_009051	G	6	6	258088	258093	0 %	0 %	100 %	0 %	126178229
5513	NC_009051	CAG	2	6	258154	258159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178229
5514	NC_009051	GAT	2	6	258174	258179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178229
5515	NC_009051	CTA	2	6	258228	258233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178230
5516	NC_009051	GAA	2	6	258240	258245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178230
5517	NC_009051	TCA	2	6	258260	258265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178230
5518	NC_009051	TCA	2	6	258281	258286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178230
5519	NC_009051	GGC	2	6	258896	258901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178231
5520	NC_009051	C	9	9	258911	258919	0 %	0 %	0 %	100 %	126178231
5521	NC_009051	GGGC	2	8	258924	258931	0 %	0 %	75 %	25 %	126178231
5522	NC_009051	CGG	2	6	258949	258954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178231
5523	NC_009051	CTC	2	6	258962	258967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178231
5524	NC_009051	GAC	2	6	259040	259045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178231
5525	NC_009051	CGA	2	6	259069	259074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178231
5526	NC_009051	ATG	2	6	259124	259129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178231
5527	NC_009051	GTC	2	6	259163	259168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178231
5528	NC_009051	ATC	2	6	259179	259184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178231
5529	NC_009051	GTC	2	6	259208	259213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178231
5530	NC_009051	ACCC	2	8	259259	259266	25 %	0 %	0 %	75 %	126178231
5531	NC_009051	CTGCT	2	10	259277	259286	0 %	40 %	20 %	40 %	126178231
5532	NC_009051	C	6	6	259352	259357	0 %	0 %	0 %	100 %	126178231
5533	NC_009051	ACAA	2	8	259401	259408	75 %	0 %	0 %	25 %	126178231
5534	NC_009051	AATA	2	8	259410	259417	75 %	25 %	0 %	0 %	126178231
5535	NC_009051	TGA	2	6	259464	259469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178232
5536	NC_009051	GAA	2	6	259502	259507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178232
5537	NC_009051	GAT	2	6	259519	259524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178232
5538	NC_009051	GAA	2	6	259546	259551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178232
5539	NC_009051	TCA	2	6	259590	259595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178232
5540	NC_009051	GCA	2	6	259657	259662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178232
5541	NC_009051	AGGG	2	8	259682	259689	25 %	0 %	75 %	0 %	126178232
5542	NC_009051	GC	4	8	259694	259701	0 %	0 %	50 %	50 %	126178232
5543	NC_009051	AGC	2	6	259773	259778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178232
5544	NC_009051	CAT	2	6	259844	259849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178233
5545	NC_009051	GCGA	2	8	259944	259951	25 %	0 %	50 %	25 %	126178233
5546	NC_009051	GCT	2	6	259953	259958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178233
5547	NC_009051	TCA	2	6	259966	259971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178233
5548	NC_009051	TGCG	2	8	259991	259998	0 %	25 %	50 %	25 %	126178233
5549	NC_009051	GAT	2	6	260057	260062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178233
5550	NC_009051	CGGA	2	8	260064	260071	25 %	0 %	50 %	25 %	126178233
5551	NC_009051	GAAG	2	8	260087	260094	50 %	0 %	50 %	0 %	126178233
5552	NC_009051	AGC	2	6	260149	260154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178233
5553	NC_009051	GC	3	6	260153	260158	0 %	0 %	50 %	50 %	126178233
5554	NC_009051	ACG	2	6	260251	260256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178233
5555	NC_009051	TCG	3	9	260314	260322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178233
5556	NC_009051	CTC	2	6	260361	260366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178233
5557	NC_009051	GGA	2	6	260396	260401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178233
5558	NC_009051	CCGA	2	8	260412	260419	25 %	0 %	25 %	50 %	126178233
5559	NC_009051	CGG	2	6	260448	260453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178233
5560	NC_009051	ACT	2	6	260537	260542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178233
5561	NC_009051	GCGG	2	8	260558	260565	0 %	0 %	75 %	25 %	126178233
5562	NC_009051	GGA	2	6	260591	260596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178233
5563	NC_009051	TCA	2	6	260602	260607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178233
5564	NC_009051	GGA	2	6	260674	260679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178233
5565	NC_009051	GAA	2	6	260703	260708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178233
5566	NC_009051	CGT	2	6	260740	260745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178233
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5568	NC_009051	TCT	2	6	260839	260844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178233
5569	NC_009051	GCTC	2	8	260885	260892	0 %	25 %	25 %	50 %	126178233
5570	NC_009051	GAA	2	6	260932	260937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178233
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5572	NC_009051	GGA	2	6	261072	261077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178233
5573	NC_009051	GGCA	2	8	261186	261193	25 %	0 %	50 %	25 %	126178233
5574	NC_009051	GGCT	2	8	261222	261229	0 %	25 %	50 %	25 %	126178233
5575	NC_009051	CTC	2	6	261249	261254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178233
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5580	NC_009051	CTG	2	6	261354	261359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178233
5581	NC_009051	TCG	2	6	261403	261408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178233
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5587	NC_009051	TCG	2	6	261568	261573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178233
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5589	NC_009051	CGG	3	9	261626	261634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178233
5590	NC_009051	ATTCG	2	10	261640	261649	20 %	40 %	20 %	20 %	126178233
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5597	NC_009051	TTCTG	2	10	261986	261995	0 %	60 %	20 %	20 %	126178234
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5603	NC_009051	CAT	2	6	262178	262183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178235
5604	NC_009051	CGG	2	6	262198	262203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178235
5605	NC_009051	TCG	2	6	262210	262215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178235
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5609	NC_009051	CTG	2	6	262329	262334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178235
5610	NC_009051	AG	3	6	262336	262341	50 %	0 %	50 %	0 %	126178235
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5613	NC_009051	CAT	2	6	262472	262477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178235
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5619	NC_009051	CCT	2	6	262778	262783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178236
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5982	NC_009051	GGC	2	6	279622	279627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178251
5983	NC_009051	ACA	2	6	279640	279645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126178251
5984	NC_009051	GTG	2	6	279651	279656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178251
5985	NC_009051	CAG	2	6	279720	279725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178251
5986	NC_009051	GCGA	2	8	279736	279743	25 %	0 %	50 %	25 %	126178251
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